Organizacje pro bono korzystające z serwisów internetowych, w których odpłatnie promują swoją działalność są objęte obowiązkiem podatkowym. Wynika to z faktu, że wiele portali internetowych nie ma w naszym kraju siedziby, ani miejsca prowadzenia działalność (rezydencji podatkowej). W takich przypadkach stosuje się szczególne obowiązki podatkowe uwarunkowane polskim prawem.
Podatnicy, którzy nie mają w Polsce siedziby podlegają opodatkowaniu od dochodów. Wynika to z faktu, że świadczone przez nie usługi reklamowe na rzecz organizacji pro bono powodują powstanie dochodu. Według ustawy podatek z tego tytuły wynosi 20% przy jednoczesnym nakazie obliczenia, pobrania i wpłacenia do urzędu skarbowego przez nabywcę, w tym wypadku organizację pro bono.
W polskim prawie, wobec międzynarodowych umów stosuje się przepisy, które pozwalają uniknąć podwójnego opodatkowania. W tym konkretnym przypadku można nawet całkowicie uniknąć opłat podatkowych. Wystarczy posiadać ważny certyfikat rezydencji podatkowej usługodawcy, wydany przez organy podatkowe w kraju innym niż Polska, potwierdzający zagraniczną siedzibę do celów podatkowych.
Prawo nie określa przepisami formę certyfikatu, jednak by uniknąć opodatkowania organizacja pro bono powinna posiadać go w oryginale, kopii poświadczonej przez uprawniony organ lub formę elektroniczną.
Organizacja pro bono zobowiązana jest również do przekazywania informacji urzędowi skarbowemu o zakupionej usłudze w zagranicznym serwisie. Tyczy się to również sytuacji z zastosowaniem umowy o uniknięciu podwójnego opodatkowania.
Wynagrodzenie dla zagranicznego serwisu może także powodować obowiązki z tytułu VAT, obciążające polskie organizacje. Sektor pro bono uznawany jest za płatnika VAT ze względu na prowadzoną działalność zarobkową, gdzie zyski przekazywane są na wyznaczony cele. Nabycie usług reklamowych w zagranicznych serwisach powoduje, że podatnikami stają się również podmioty nabywające. W konsekwencji powstaje obowiązek rozliczeniowy oraz konieczność składania miesięcznych deklaracji.
